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IRB 科學家確定基因組上基因編輯可能導致不良反應的關鍵點
發(fā)布時間:2022-08-18 09:58:07作者:輝駿生物-fitgene

CRISPR/Cas9 是一種常用的、非常精確的基因編輯技術,由 Jennifer A. Doudna 和 Emmanuelle Charpentier 開發(fā),獲得了 2020 年諾貝爾化學獎。  CRISPR 通常被稱為“基因剪刀”,它允許將所需的 DNA 序列引入(實際上)基因組的任何位置,從而修飾或滅活基因。  這項技術廣泛用于生物醫(yī)學研究,一些基于 CRISPR 的療法正在臨床試驗中用于治療人類血液疾病、某些類型的癌癥和 HIV 等疾病。


由 ICREA 研究員 Fran Supek 博士領導的 IRB Barcelona 的科學家們現(xiàn)在報告說,根據(jù)人類基因組的目標位點,CRISPR 基因編輯會導致細胞毒性和基因組不穩(wěn)定性。   這種不需要的影響是由關鍵腫瘤抑制蛋白 p53 介導的,并且由編輯點附近的 DNA 序列和周圍區(qū)域的各種表觀遺傳因素決定。


使用計算方法,基因組數(shù)據(jù)科學實驗室的研究人員分析了為人類細胞設計的最流行的 CRISPR 文庫,并檢測到了 3,300 個顯示出強烈毒性作用的目標點。大約 15% 的人類基因包含至少一個有毒的編輯點。


可以在多個位置編輯特定基因。  首席研究員 Miguel-Martin álvarez 博士說:“對于調(diào)控重要或具有某些表觀遺傳標記的基因區(qū)域是最有可能觸發(fā) p53 反應的區(qū)域,因此應作為一般建議避免使用?!?br/>


p53 介導的毒性和腫瘤發(fā)生

p53是一種被稱為基因組守護者的蛋白質(zhì)。  它檢測 DNA 損傷并導致細胞停止分裂并可能導致程序性死亡,從而阻止它們復制和擴大其 DNA 中的“錯誤”。  因此,p53 是針對癌癥和其他 DNA 損傷相關并發(fā)癥的天然保護機制的基礎。


CRISPR 基因編輯通常需要切割兩條 DNA 鏈。  在某些情況下,這種操作可以觸發(fā) p53 反應,其中編輯的細胞可以被“標記”為受損然后被消除,從而降低基因編輯過程的效率。


然而,關于 p53 和基因編輯的主要并發(fā)癥是,克服 CRISPR 編輯的細胞可能正是因為 p53 功能缺陷而這樣做。  也就是說,這些細胞可能不太能夠檢測 DNA 損傷和/或標記細胞以進行程序性死亡。   結果,基因編輯程序最終可能有利于具有不穩(wěn)定基因組的細胞群,這意味著它們?nèi)菀追e累進一步的突變,從而增加患惡性腫瘤的風險。


“這種不良后果可能會導致基因組不穩(wěn)定的風險,這在體外 CRISPR 療法的背景下是非常不受歡迎的,其中來自患者的細胞在實驗室中被編輯并重新引入患者體內(nèi)。我們希望我們的研究提供一些指導如何設計更安全的 CRISPR 試劑 ,并鼓勵對這個問題進行進一步研究,”Supek 博士總結道。


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